Quelques jours à peine après avoir pris possession de la Cité, les techniciens sont parvenus à établir un intranet fonctionnel permettant une communication interne entre les différents membres du personnel.

La baie des jumpers est située sous le toit de la tour centrale de la cité et juste au-dessus de la salle d'embarquement d'Atlantis. Elle abrite de petits vaisseaux spatiaux de type puddle jumper. Ces derniers peuvent sortir par le toit de la cité pour des destinations proches (continents, orbite, système solaire) mais aussi passer la porte des étoiles.

Le niveau 10 correspond au centre névralgique de la Cité. Les grandes décisions y sont prises, le contrôle sur Atlantis et ses environs assuré, et la Porte des Etoiles surveillée depuis les balcons qui surplombent la plate-forme.

Les Terriens ont décidé d'implanter l'équipement médical au niveau 8, les locaux permettant la mise en place d'une grande pièce pour l'infirmerie mais aussi plusieurs cellules d'isolement. Quelques cabinets médicaux complètent l'installation.

Implantée directement sur les lieux de recherche des Anciens, les scientifiques disposent là d'une zone à la hauteur de leur talent.

Le niveau 5 est placé sous étroite surveillance de part la présence de cellules pour les membres les plus récalcitrants mais aussi par l'armurerie. De la Terre, les Terriens ont amené avec eux un arsenal qui rendrait jaloux Rambo.

Comme Atlantis peut abriter beaucoup de monde il y a beaucoup de pièces faisant office de chambres privées. Elles sont plutôt petites et conçues pour une ou deux personnes.

Plutôt sandwich au thon ou jambon ? Dégustez les nombreuses spécialités du mess mais aussi venez vous dépenser dans le gymnase ainsi qu'avec ses nombreux instruments de torture.

Atlantis est vaste et pourtant les activités et les membres du personnel se concentrent sur la tour principale, mais il paraît que le coucher de soleil depuis l'Aile Ouest est magnifique. Peut-être aussi que les autres Ailes renferment d'autres découvertes...

A vingt-cinq minutes de jumper se trouve un vaste continent boisé et fertile. Les Athosiens y ont construit un solide campement et cultivent les terres des alentours. Peu à peu certaines Terriens s'implantent aussi.